python - Matplotlib 线重叠/分辨率

Question

我正在 Matplotlib 中绘制一个图，当不同的线具有不同的 x 值时，它们必须不重叠。出于某种原因，当我画线时，如果它们靠得足够近(但不重叠)，就会出现重叠。例如，

fig = plt.figure(num=None, facecolor='w', edgecolor='k')
ax = fig.add_subplot(2, 1, 1)
ax.plot((0, 10000000), (3, 3), linewidth = 2, markersize = 0, clip_on = True, aa = True)
ax.plot((10000001, 200000001), (3, 3), linewidth = 1, markersize = 0, clip_on = True, aa = True)

plt.savefig('test.png', format='png')

我希望蓝线和绿线完全不重叠，因为 10000000 < 10000001。

我把蓝线做得稍微粗一些，所以如果你放大，你可以看到蓝线和绿线是如何重叠的。我把dpi调的很高，所以不是分辨率问题。我将不得不处理大量数据，因为我正在处理基因组数据——大量数据是一个问题吗？当我使用 (0 to 10000) 和 (10001, 20000) 的 x 值进行绘图时，问题仍然存在。

非常感谢您的帮助。

Answer 1

与 Line2D 对象的 cap 样式有关，默认样式为 'projecting'，这会导致重叠，请查看放大的 PDF:

我们想把它改成'butt'风格:

L1=ax.plot((0, 10000000), (3, 3), linewidth = 2, markersize = 0, clip_on = True, aa = True)
L2=ax.plot((10000001, 200000001), (3, 3), linewidth = 1, markersize = 0, clip_on = True, aa = True)
for item in L1+L2:
    item.set_solid_capstyle('butt')

当然，差距非常小，因为它是 1/10000000。

或者，如果您愿意，一个快速的肮脏解决方案是在 (10000000.5, 3) 处绘制一个 size=1 的白色小圆圈标记。

---

• matplotlib.pyplot.plot可以使用 matplotlib.lines.Line2D 中的 kwargs ，其中包括参数 solid_capstyle
• 这是在绘图调用中设置 solid_capstyle 的附加示例

fig, ax = plt.subplots(1, 1, figsize=(8, 4))

L1 = ax.plot((0, 1), (1, 1), linewidth=10, label='No capstyle')
L2 = ax.plot((1, 2), (1, 1), linewidth=7, label='No capstyle')


L3 = ax.plot((0, 1), (0.9, 0.9), linewidth=10, solid_capstyle='butt', label='With butt capstyle')
L4 = ax.plot((1, 2), (0.9, 0.9), linewidth=7, solid_capstyle='butt', label='With butt capstyle')

ax.set_ylim(0, 2)
ax.grid()
ax.legend()