java - 无法访问 jar 文件

Question

我在biotoolbox包中运行了一个perl脚本。(http://code.google.com/p/biotoolbox/) 但收到与 jarfile 相关的错误消息。

$./bar2wig.pl

 This program will convert bar files to a wig file
 Usage:
 bar2wig.pl [--options...] <filename>

  Options:
  --in <filename> or <directory>
  --out <filename> 

$  ./bar2wig.pl --in  /Users/biotoolbox/scripts/ --out example

This program will convert bar files to a wig file
checking input file(s)....
converting to gr files...
Unable to access jarfile /usr/local/USeq/Apps/Bar2Gr
writing wig file...
cleaning up temp files... done

我不知道如何处理错误:无法访问 jarfile 。 尽管这个脚本是perl，但它看起来像是与java相关的错误。

对此有何评论？

Answer 1

是的，显然它找不到 jarfile。阅读 Wiki 条目 jar ，但足以说明它只是一个可移植的 java 文件包。

您需要下载该 jar 文件并定义它在配置文件 biotoolbox.cfg 中的位置。