sqlite - 通过 RSqlite 的 SQLilte 查询比 sqlite3 命令行界面慢得多

Question

我正在使用 RSQLite 包对本地 SQLite 数据库进行查询，对于某些查询，RSQLite 接口(interface)非常慢。

作为具体示例，使用 sqlite3 命令行实用程序运行以下查询需要不到一秒的时间:

$ sqlite3 data/svn.db
SQLite version 3.7.5
Enter ".help" for instructions
Enter SQL statements terminated with a ";"
sqlite> select count(distinct svn_path.revision)  FROM src INNER JOIN svn_path ON src.filename=svn_path.path;
5039

但是 R 中的等效查询需要两分钟多一点，并且 100% 使用了我的一个 CPU:

> library(RSQLite)
Loading required package: DBI
> con <- dbConnect(SQLite(), dbname="data/svn.db")
> dbGetQuery(con, "select count(distinct svn_path.revision)  FROM src INNER JOIN svn_path ON src.filename=svn_path.path")
  count(distinct svn_path.revision)
1                              5039

为什么通过 R 接口(interface)的性能会慢很多？

请注意，我在 Mac OS X 10.6.6 上使用 R64 2.10.1。

Answer 1

重要的是您拥有的 RSQLite 版本。您的 R 版本似乎已经超过一年了，所以如果您的 RSQLite 和 Benoit 所建议的一样旧，那么它可能是一个更旧的引擎(例如 3.6.4)。