Rmarkdown 无法正确重现 bash 代码

Question

我正在使用 Rmarkdown 来显示一些 bash 代码:

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title: "Untitled"
author: "JPD"
date: "20 December 2016"
output: html_document
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```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

```{r gp.setup, engine= 'bash', eval=FALSE}

##Change names to remove dots
g.rename raster=gp_ortho.1,gp_ortho_1,gp_ortho.2,gp_ortho_2,\
gp_ortho.3,gp_ortho_3

##Group bands together
i.group --verbose group=gp_combo input=gp_ortho_1@gp1,gp_ortho_2@gp1,\
gp_ortho_3@gp1
```

但是，当编入 html 时，g.rename 行大部分消失了。作为对比，下面的 i.group 命令显示正确:

执行此操作的 g.rename 代码行是什么？是 . 吗？

Answer 1

bash 将点/句点 (.) 视为执行后续操作的命令，因此它不是打印文字字符，而是查找名为 1< 的文件、2 和 3。

我没有将 GRASS 设置为在不启动 session 的情况下工作，但我的猜测是，如果您这样做，您的脚本会正确解释 g.rename 命令并查找您指定的光栅文件.

我假设 GRASS 没有在你的 Rmarkdown 文件中设置，所以它只是打印 g.rename... 字符，然后将 . 作为一个文件来执行所以不打印下面的内容。要使其正确打印，请在文件名中使用 . 以外的内容，设置 Rmarkdown session 以将 g.rename 理解为命令，或使用转义字符\:

```{r gp-setup, engine="bash", eval=FALSE}
# Change names to remove dots

g.rename raster=gp_ortho\.1,gp_ortho_1,gp_ortho\.2,gp_ortho_2, \
gp_ortho\.3,gp_ortho_3

## Group bands together
i.group --verbose group=gp_combo input=gp_ortho_1@gp1,gp_ortho_2@gp1, \
gp_ortho_3@gp1
```