java - 如何使用 Rcaller 将数据库表从 java 转移到 R？

Question

我目前正在使用 rcaller 基于 mysql 数据库进行分析回归。现在我一直在研究如何将数据库表从 java 转移到 R。 这是我试过的。

Class.forName("com.mysql.jdbc.Driver");
            conn = DriverManager.getConnection(DB_URL,USER,PASS);
            stmt = conn.createStatement();
            String sql;
            sql = "SELECT bf,ibt,rate FROM testing";
            ResultSet rs = stmt.executeQuery(sql);
            while(rs.next()){
               float bf  = rs.getFloat("bf");

            }           
            RCaller caller = new RCaller();
            RCode code = new RCode();  
            caller.setRscriptExecutable("C:/Program Files/R/R-2.15.0/bin/Rscript.exe");
            code.clear();
            caller.setRCode(code);

            code.R_require("rpart");          
            code.addRCode("ad.apprentissage= rpart(rate~, data=rs,cp=0.1)"); 
            code.addRCode("predArbreDecision=predict(ad.apprentissage,newdata=rs,type='class') "); 

            File file = code.startPlot();
            code.addRCode("plot(ad.apprentissage)"); 
            caller.runOnly();
            ImageIcon ii = code.getPlot(file);
            code.showPlot(file);

但是下面这一行似乎不起作用:

  code.addRCode("ad.apprentissage= rpart(rate~, data=rs,cp=0.1)"); 

我运行这个程序没有错误，但输出为空。

Answer 1

您可以使用 3.0 版 RCaller 使用 data.frames 将数据从 Java 传递到 R。版本 3.0 对 data.frame 对象有最低限度的支持，它可以像这样使用:

Object[][] objects = new Object[][]{{1,2,3}, {"a", "b", "c"}};
String[] names = new String[] {"numbers", "letters"};
DataFrame dataFrame = DataFrame.create(objects, names);

RCode 类中的 addDataFrame() 方法可用于将数据从 Java 传输到 R:

RCode rCode = RCode.create();
rCode.addDataFrame("df", dataFrame);

并且此 data.frame 对象的插槽在 R 中是可访问的。例如

rCode.addRCode("mymean <- mean(df$numbers)");

为 df 中的数字均值创建一个变量。由于 RCaller 以高效的方式传递数据帧对象，因此传输数据的成本并不大，尤其是对于数据帧。

除此之外，您还可以创建一个直接连接到数据库引擎的 R 文件，并在 R 端执行 sql 查询。例如，如果您的数据存储在 MySQL 数据库中，则包 RMySQL 是一个不错的选择。