我有 122864 行数据。我将数据存储在 HDF5 文件中。使用 pandas 进行数据处理。对于记录中的每个唯一 ID,都有一个时间戳相关联,指示用户打开应用程序的时间。我想获得应用程序两次点击之间的平均持续时间。
1283 2015-04-01 08:07:44.131768
1284 2015-04-01 08:08:02.752611
1285 2015-04-01 08:08:02.793380
1286 2015-04-01 08:07:53.910469
1287 2015-04-01 08:08:03.305893
1288 2015-04-01 08:07:44.843050
1289 2015-04-01 08:07:54.767203
1290 2015-04-01 08:08:03.965367
1291 2015-04-01 08:07:45.924854
1292 2015-04-01 08:07:55.408593
1293 2015-04-01 08:07:46.365128
class User(object):
'''
Properties and function related to each object.
attributes:
datetime: a list of hit timestamp for each user object
deviceid: unique deviceid
'''
def __init__(self, User, device_id):
self.datetime = pd.to_datetime(list(User['datetime']))
self.deviceid = device_id
self.avrgtime = 0.0
avgtime.setdefault(self.deviceid, 1)
def avg_duration(self):
'''
average duration b/w hits for each user.
'''
for i,time in enumerate(self.datetime[:-1]):
self.avrgtime += abs(self.datetime[i+1] - time).total_seconds()
avgtime[self.deviceid] = self.avrgtime/len(self.datetime)
pp.pprint(avgtime)
#avgtime[] = datetime.strptime(time, '%Y-%m-%d %H:%M:%S.%f')
pass
def eachdevice(gstore):
count = 0
for did in list(gstore['data'].drop_duplicates('device_id')['device_id']):
auser = gstore.select('data', where="device_id == did")
gamer = User(auser, did)
gamer.avg_duration()
count+=1
print count
#main workshore
if __name__ == '__main__':
try:
path = os.path.abspath(sys.argv[1])
with pd.HDFStore('Gamer.h5') as gstore:
eachdevice(gstore)
except IndexError:
print('\nPass path of the HDF5 file to be analyized...EXITING\n')
到目前为止,我正在做的是遍历每个 unique_id 并使用 pandas dataframe select 查询每个唯一 id 的日期时间。这将返回日期时间对象数据框。我将其转换为列表,然后循环计算两个时间戳之间的平均差异。 这种方法需要很多时间。有没有办法在使用 Pandas 时做到这一点?
请帮忙。
编辑:在注释掉所有计算部分后,我运行代码。我认为这个 auser = gstore.select('data', where="device_id == did") 一直在占用时间。如何提高?任何替代或更好的方法? %timeit 结果:1 次循环,最好的 3 次:每次循环 13.3 秒,迭代 1000 次。
编辑: 示例数据:
device_id datetime
0 c4be7e55d98914647c51329edc2ab734 2015-03-30 22:00:05.922317
1 05fed9f8e07c3cac457723286d36f621 2015-03-30 22:00:07.895672
2 783faeed9fe35a3f45b521b3a6667a2d 2015-03-30 22:00:05.529631
3 c2022ad838cec35bdb12fc3a6e2cf452 2015-03-30 21:59:59.043905
4 a8a04268ee0c22b26af59e053390cf6f 2015-03-30 22:00:14.248542
5 4e5ed16b44b9cd38c408859d1d241e2d 2015-03-30 22:00:02.391719
6 c0bfd3f9046855ffaaec4d99c367fd8c 2015-03-30 22:00:18.649193
7 95f1182c6e4d601ba0b20f5204168ecb 2015-03-30 22:00:13.629728
8 a85caa7e0a4a7d57e6330c083daff326 2015-03-30 22:00:08.340469
9 46cdbee963814cdb4e6a0ac0049b8fc6 2015-03-30 22:00:23.152820
10 3c8bf70679cd9c6f18aa52d06e0e181d 2015-03-30 22:00:17.619251
11 52bc4e3d9dc373d89ec31effe10e6f30 2015-03-30 22:00:11.591954
12 3477eb25e26b6bff0bfc6c3ee59a5f40 2015-03-30 22:00:25.745083
13 e7bf8ae864f2148831628a6f2e8e406e 2015-03-30 22:00:20.911568
14 a15af8faffd655a3e80f85840bbf3c2a 2015-03-30 22:00:19.017887
15 9d9f71f080c0cf478ec4117e78ff89ee 2015-03-30 22:00:28.435585
16 1633d88738316e3602890499b1f778b1 2015-03-30 22:00:24.108234
17 3362daf99f11541acbf45e70fdaf5f49 2015-03-30 22:00:24.512366
18 96c3c005eaaaa8d6af3f2443ca8f73df 2015-03-30 22:00:29.713550
19 002642b9ed495f84318fcb42557f53e1 2015-03-30 22:00:37.936647
最佳答案
让我们创建一个与您的类似的包含 150000 行的虚拟数据集。
>>> import pandas as pd
>>> data = pd.DataFrame({
... 'device_id': pd.np.random.randint(0, 100, 150000),
... 'datetime': pd.Series(pd.np.random.randint(1429449000, 1429649000, 150000) * 1E9).astype('datetime64[ns]')
... }).sort('datetime')
>>> data.head()
datetime device_id
113719 2015-04-19 13:10:00 34
120323 2015-04-19 13:10:01 22
91342 2015-04-19 13:10:04 9
61170 2015-04-19 13:10:08 27
103748 2015-04-19 13:10:11 65
您可以使用.groupby
来预先计算组。这使您可以轻松识别给定 device_id
的所有 datetime
。
>>> groups = data.groupby('device_id')
>>> data.ix[groups.groups.get(34)].head() # Get the data for device_id = 34
datetime device_id
113719 2015-04-19 13:10:00 34
105761 2015-04-19 13:11:30 34
85903 2015-04-19 13:18:40 34
36395 2015-04-19 13:19:55 34
108850 2015-04-19 13:20:06 34
从这里开始,它可以足够快地识别平均差异。
>>> def mean_diff(device_id):
... return data['datetime'][groups.groups.get(device_id)].diff().mean()
...
>>> mean_diff(34)
Timedelta('0 days 00:02:14.470746')
由于 .groupby
预先计算结果,因此每次连续查找都非常快。这一步在 150000 行上大约需要 2 毫秒。
In [68]: %timeit mean_diff(34)
100 loops, best of 3: 2.03 ms per loop
您还可以像这样在所有 device_id
上计算它:
>>> time_diff = groups.apply(lambda df: df.datetime.diff().mean())
>>> time_diff.head()
device_id
0 00:02:12.871504
1 00:02:10.464099
2 00:02:09.550000
3 00:02:15.845003
4 00:02:14.642375
dtype: timedelta64[ns]
这也相当快。对于这 150,000 行,它需要不到 50 毫秒。当然,您的里程数可能会有所不同。
In [79]: %timeit groups.apply(lambda df: df.datetime.diff().mean())
10 loops, best of 3: 46.6 ms per loop
关于python - 使用 Pandas 计算日期时间行平均值的最快方法,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/29722704/