python - 尽管 MPICC 安装正确且有效，但安装 mpi4py 时出现 MPICC 错误

Question

我已经在 Ubuntu 12.04 上成功安装了 MPICH，并且可以让简单的测试 C 程序按预期编译和运行。

现在我尝试使用 pip 安装 mpi4py，只需通过 pip install mpi4py。我首先执行了 sudo apt-get build-dep python-mpi4py，效果很好。

我正在使用 virtualenv，所以这个 mpi4py 安装没有使用 sudo(也不应该)。

这是我在一组冗长的控制台输出后遇到的命令和错误，看起来像正常的编译内容(如果需要，我可以打印所有控制台输出，但我认为大部分是表明没有问题的标准编译器警告)。

(local-dev)espears@espears-w:~$ pip install mpi4py
src/ext/mpi_swig.c: In function ‘SWIG_Python_AddErrorMsg’:

src/ext/mpi_swig.c:859:5: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]

cc1: some warnings being treated as errors

error: command '/usr/bin/mpicc' failed with exit status 1

----------------------------------------
Cleaning up...
Command /home/espears/.virtualenvs/local-dev/bin/python -c "import setuptools, tokenize;__file__='/home/espears/.virtualenvs/local-dev/build/mpi4py/setup.py';exec(compile(getattr(tokenize, 'open', open)(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-5o6OwN-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --install-headers /home/espears/.virtualenvs/local-dev/include/site/python2.7 failed with error code 1 in /home/espears/.virtualenvs/local-dev/build/mpi4py
Traceback (most recent call last):
  File "/home/espears/.virtualenvs/local-dev/bin/pip", line 11, in <module>
    sys.exit(main())
  File "/home/espears/.virtualenvs/local-dev/local/lib/python2.7/site-packages/pip/__init__.py", line 185, in main
    return command.main(cmd_args)
  File "/home/espears/.virtualenvs/local-dev/local/lib/python2.7/site-packages/pip/basecommand.py", line 161, in main
    text = '\n'.join(complete_log)
UnicodeDecodeError: 'ascii' codec can't decode byte 0xe2 in position 31: ordinal not in range(128)

但是，which mpicc 给出了预期的结果:/usr/bin/mpicc 并且如上所述，如果我使用此 mpicc 来编译简单的 .c 测试程序，它们工作正常。

我看到一些链接描述了用于编译 MPI 的标志选项 fPIC，但是，我只是使用 apt-get 来安装 MPI，并且特别希望这些工具仅依赖 native Ubuntu 包，而不是维护单独的安装说明以手动构建它们。

如何确定 mpicc 在 mpi4py 安装过程中失败的原因？

已添加

控制台输出的以下内容似乎是导致问题的编译命令。

building 'mpi4py._mpi_swig' extension

/usr/bin/mpicc -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -g -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wformat-security -Werror=format-security -fPIC -I/usr/include/python2.7 -c src/ext/mpi_swig.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/src/ext/mpi_swig.o

当我自己从命令行尝试时，出现以下错误:

(local-dev)espears@espears-w:~$ /usr/bin/mpicc -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -g -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wformat-security -Werror=format-security -fPIC -I/usr/include/python2.7 -c src/ext/mpi_swig.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/src/ext/mpi_swig.o
gcc: error: src/ext/mpi_swig.c: No such file or directory
gcc: fatal error: no input files
compilation terminated.

Answer 1

只需将 pip 指向 MPI4PY 包 url，而不是包名称，我就能够成功地解决这个问题，而无需对我的系统进行任何更改:

pip install https://bitbucket.org/mpi4py/mpi4py/downloads/mpi4py-1.3.1.tar.gz