python - 阅读 igraph 中的 Disconected Graph for python

标签 python graph igraph

我想知道使用 igraph for python 读取断开的无向图的最佳方法。例如,如果我有一个简单的图形,其中 0 链接到 1,而 2 是一个未连接到任何其他节点的节点。我无法让 igraph 从边缘列表格式(Graph.Read_Edgelist(...))读取它,因为每一行都必须是边缘,所以不允许以下内容:

0 1
2

我一直想知道在这种情况下邻接矩阵是否是我唯一/最好的选择(我可以通过这种表示法让它工作)?我更喜欢一种我可以通过查看数据来理解数据的格式(当涉及到矩阵格式时,这真的很难)。

提前致谢!

最佳答案

有允许孤立顶点的 LGL 格式(参见 Graph.Read_LGL)。格式如下所示:

# nodeID
nodeID2
nodeID3
# nodeID2
nodeID4
nodeID5
nodeID
# isolatedNode
# nodeID5

我想你已经明白了基本的想法;以哈希标记开头的行表示正在定义一个新节点。此后,这些行指定了刚刚定义的节点的邻居。如果您需要一个孤立的节点,您只需在行中指定以哈希标记为前缀的节点 ID,然后继续下一个节点。

可以找到有关 LGL 格式的更多信息 here .

您可能想要检查的另一种相当易读的格式是 GML format igraph 也支持。

关于python - 阅读 igraph 中的 Disconected Graph for python,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/6780500/

相关文章:

python - 通过pyodbc在SQL查询中指定列条件会导致错误

python - 获取订购值

graph - 绘制图表的最佳方法

r - 节点不尊重 ggraph/igraph 中的分面

python - 如何使用 wxpython 在位图中绘制文本?

python - 从一个key获取一个key的pygame事件

r - 使用 par(mfrow) 编译的图形面板的通用主标题

java - 无法使用 Dijkstra 算法找到最短路径?

r - LFR 基准与随机 block 模型

r - tidygraph 和 igraph - 从数据帧差异构建图