python - 为 python 源代码创建 R 包

Question

我用 python 编写了一个小程序，我想创建一个 R 接口(interface)/R 包来运行这个程序。

我看到 Rpy 有很多函数可以从 python 调用 R，rPython 可以从 R 调用 python 函数。我还看到一些关于如何使用 C++ 源代码创建 R 包的教程。但是，我不清楚如何从 python 源代码创建 R 包。

因为一切都是用 python 编写的，我的目标是创建一个可以调用 python 程序的 R 包:

python程序(输入1，输入2，输入3)

任何有关教程/入门方法的建议都将不胜感激!

Answer 1

如果你的 python 脚本不需要返回任何东西给 R，你可以使用 base R，它可以像这样简单:

pythonProgram <- function(input1, input2, input3) {

  command <- paste("pyprog.py -i1",input1,"-i2",input2,"-i3",input3)
  shell(command)

}

查看shell(以及system)的帮助。两者都允许您运行任意系统命令。

如果 python 脚本需要将数据返回给 R，您可以让 python 脚本写入日志文件，然后让 R 读取它。或者你可以让你的 python 脚本写入标准输出并让 shell 或 system 读取该输出。