python - scipy-cluster 定制生成的树状图

Question

这是对 Dendrogram generated by scipy-cluster does not show 的跟进.

from matplotlib.pyplot import show
from scipy.spatial.distance import pdist
from scipy.cluster.hierarchy import linkage, dendrogram
from numpy.random import rand

X = rand( 5, 3 )
X[0:5, :] *= 2
Y = pdist( X )
Z = linkage( Y )
dendrogram( Z )
show()

当 dendrogram() 返回一个字典时，pyplot 正在拾取键 ivl, leaves, color_list, icoord。在传递给 pyplot 之前如何修改标签和叶子长度？

做类似的事情:

d=dendrogram( Z )
d['leaves']=['label1','label2','label3','label4','label5']

似乎没有影响。

叶子的长度应该是这样的:

Answer 1

根据dendrogram documentation ，您应该能够在调用它时定义标签(通过 labels 或 leaf_label_func args)。因此无需事后尝试篡改标签。