linux - 使用for循环linux基于两个文件进行查询

Question

我正在尝试使用 for 循环基于两个变量进行查询...使用以下命令

for i in $(< enhancer.list)
do for j in $(< bp.list)
do
awk ' BEGIN {FS=OFS="\t"};
{if ($1=="chr2" && $7<= $j && $8>= $j ) {print $0}}' $i.txt > $i.result.$j.txt
done;
done;

其中“enhancer.list”是文件名； “bp.list”是将在 enhancer.list 的文件中查找的数字列表。

我无法检索到与 awk 查询匹配的任何行。 $j 是否有可能在方括号内不起作用() 请提出任何建议。

谢谢

Answer 1

使用 -v 选项将 j 分配给 awk 变量。

awk -v j=$j ' 
    BEGIN {FS=OFS="\t"};
    $1 == "chr2" && $7 <= $j && $8 >= j' $i.txt > $i.result.$j.txt

我省略了 {print $0}，因为这是条件为真时的默认操作。