c - 在 Eclipse 中编译简单的 HDF5 示例时获取 ‘undefined reference to’

Question

我刚开始使用 C 和 HDF5，所以我的问题可能很容易回答。

我尝试了来自 http://beige.ucs.indiana.edu/I590/node122.html 的示例代码创建 HDF5 文件。

#include "hdf5.h"
#define FILE "file.h5"

main() {

   hid_t       file_id;   /* file identifier */
   herr_t      status;

   /* Create a new file using default properties. */
   file_id = H5Fcreate(FILE, H5F_ACC_TRUNC, H5P_DEFAULT, H5P_DEFAULT);

   /* Terminate access to the file. */
   status = H5Fclose(file_id);
}

我尝试用 Eclipse 编译它并收到 5 条错误消息:

make: *** [Read_HDF5] Error 1
skipping incompatible /usr/lib/libc.so when searching for -lc
undefined reference to `H5check_version'
undefined reference to `H5Fcreate'
undefined reference to `H5Fclose'

出了什么问题？

谢谢你的帮助!!!

Answer 1

编译时需要链接HDF5库。 你得到的错误意味着这些函数的代码丢失了，因为你没有链接包含它们的库文件。 最简单的方法是按照您提到的教程中的说明使用 h5cc 进行编译。否则，如果您更喜欢在 Eclipse 中编译，则需要搜索 linker flags 设置并添加正确的标志，您可以通过在终端中键入 h5cc -show 找到这些标志。

例如，对我来说，h5cc -show 给出

clang -I/usr/local/include -L/usr/local/Cellar/hdf5/1.8.12/lib /usr/local/Cellar/hdf5/1.8.12/lib/libhdf5_hl.a /usr/local/Cellar/hdf5/1.8.12/lib/libhdf5.a -L/usr/local/lib -lsz -lz -ldl -lm

一 block 一 block 的:

• clang 是编译器

• -I/usr/local/include 是一个标志，告诉编译器在 /usr/local/include 目录中搜索头文件

• -L/usr/local/Cellar/hdf5/1.8.12/lib 和 -L/usr/local/lib 是告诉链接器的标志在这些目录中搜索库

• /usr/local/Cellar/hdf5/1.8.12/lib/libhdf5_hl.a 和 /usr/local/Cellar/hdf5/1.8.12/lib/libhdf5.a 是两个 HDF5 静态库的完整路径(告诉链接器链接它们)

• -lsz、-lz、-ldl 和 -lm 是告诉链接器的标志链接库 sz、z、dl 和 m

这可能有点矫枉过正。如果您的 HDF5 安装在标准位置，则只需将 -lhdf5 添加到链接器标志即可。