c - 使用 MPI 进行不同的时间测量

Question

每次运行 MPI 应用程序时，我都会得到不同的时间测量值。我是这样测量时间的:

MPIt1 = MPI_Wtime();

// do work

MPIt2 = MPI_Wtime();
MPIelapsed = MPIt2 - MPIt1;

行为是相同的，有或没有 MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);。当然，每次可执行文件运行时，程序的结果都是正确的。

检查我得到的 5x5 矩阵的极差:

0.00025 seconds // first run
0.10728 seconds // second run

此外，问题出现在较大的矩阵上，例如 2000x2000:

0.55996 seconds // first run
0.83657 seconds // second run

我是不是用错了时间？或者这是 MPI 的已知问题？请注意，时间仅从主节点报告。

我正在另一台计算机上运行该程序，我已使用 ssh 登录。我记得当我真正坐在那台电脑前时，执行速度更快了。我是唯一登录的用户:

gsamaras@pythagoras:~/konstantis/cholesky$ who
gsamaras my internet connection
gsamaras@pythagoras:~/konstantis/cholesky$

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EDIT 多次运行:

1.6035
0.422967
1.53891
0.347107
0.761991
1.22824
0.934829
0.45618
0.794225
0.554099
1.09323
0.421858
0.621015
0.889867
0.613867
0.459144
2.02273
0.67689
2.2390
1.0448
0.751333

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编辑_2

1. 通过在 run.sh 中多次调用该程序，我得到了计时。
2. 我在一台机器上运行程序，有 4 个内核。
3. 我正在使用 MPICH2。

Answer 1

我从一位同事和帕特里克那里得出的结论是:

1. MPI 的启动时间可能有很大差异。
2. 相对较小的执行时间不值得信赖，可能会有所不同 很多。