c++ - 我如何从 DICOM 文件中提取信息?

标签 c++ c file dicom

我想用c或c++写一个脚本来提取DICOM文件的头信息,我不想使用像dicomsdl这样的外部库... 当我用 Bloc-notes 打开文件时,我看到特殊字符和字符串作为患者姓名 .. 如果有人可以帮助我阅读此文件。

最佳答案

是的,我会以二进制形式打开文件,即使它可能包含字符序列。没有太深入,请考虑编写以下内容 输出到文件的记录(我将记录显示为 C 结构):

    struct rec_tag
    {
         int    id;
         char   name[50];
    };

现在,假设我使用该结构创建一个文件,如以下代码所示:

文件1.c:

/* compile as: gcc -ansi -pedantic -Wall file.c -o file_test */
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>


struct rec_tag
{
    int   id;
    char  name[50];
};

int main(int argc, char** argv)
{
    FILE*          fp = NULL;
    struct rec_tag rec1;
    struct rec_tag rec2;

    rec1.id = 20;
    strcpy(rec1.name, "thurizas");

    rec2.id = 345689;
    strcpy(rec2.name, "Marouane");

    if(NULL != (fp = fopen("./short.dat", "ab")))
    {
         fwrite(&rec1, sizeof(struct rec_tag), 1, fp);
         fwrite(&rec2, sizeof(struct rec_tag), 1, fp);

         fclose(fp);
    }
    return 0;
}

现在,假设我在 emacs 中打开这个文件,很多特殊符号(例如 ^T 和 ^@)和字符串穿插在一起。在十六进制编辑器(比如 okteta)中打开文件可能很有启发性,我们看到:

    14 00 00 00 74 68 75 72 69 7A 61 73 00 00 00 00 01 00 00 00 00 00
    00 00 ED 06 40 00 00 00 00 00 C2 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 
    00 00 00 00 A0 06 40 00 00 00 00 00 59 46 05 00 4D 61 72 6F 75 61 
    6E 65 00 7F 00 00 2E 4E 3D F6 00 00 00 00 67 03 40 00 00 00 00 00 
    FF FF FF FF 00 00 00 00 C0 B5 B3 C5 FF 7F 00 00 38 F1 CA BE 31 7F 
    00 00

现在,十六进制数字序列 74 68 75 72 69 7A 61 73 是“thurizas”的 ASCII 代码(大多数编辑器都会显示)。现在文件中的前四个字节是 ID 号。现在这提出了另一个(潜在的)问题,我在具有 x86_64 进程的计算机上创建了文件,因此整数以小端形式存储在内存中,因此序列 14 00 00 00 需要被读取...向后(因为缺少更好的术语)作为 00 00 00 14 这是 20 的 32 位十六进制表示。

另外,请注意,由于我在处理字符数组的方式上没有特别小心,所以文件中存在多余的垃圾字节。

现在,如果不知道文件的格式(数据是如何写入文件的),我将很难弄清楚如何读入它。但是,因为我们知道格式我们可以编写一个简单的程序来读取它:

文件1.c:

/* compile as: gcc -ansi -pedantic -Wall file1.c -o read_test */
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>

struct rec_tag
{
    int   id;
    char  name[50];
};

int main(int argc, char** argv)
{
     FILE*          fp = NULL;
     struct rec_tag rec1;
     struct rec_tag rec2;

     if(NULL != (fp = fopen("./short.dat", "rb")))
     {
          fread(&rec1, sizeof(struct rec_tag), 1, fp);
          fread(&rec2, sizeof(struct rec_tag), 1, fp);

          printf("id: %d, name: %s\n", rec1.id, rec1.name);
          printf("id: %d, name: %s\n", rec2.id, rec2.name);

          fclose(fp);
     }

     return 0;
 }

当运行时,产生这个结果:

    [******@broadsword junk]$ ./read_test
    id: 20, name: thurizas
    id: 345689, name: Marouane

希望这有助于解释文件并显示一种读取文件的方法。所以在你的情况下,我会执行以下步骤

  1. 获取并阅读 DICOM 文件的正式规范。
  2. 尝试“手动”读取文件。在十六进制编辑器中打开该文件,并使用规范查看您是否可以单步执行该文件并找出数据的存储方式。
  3. 编写程序读取数据。

最后,免责声明:

  1. 所有代码均使用 gcc 4.8.2 版编译并在 Centos 7 系统上运行。
  2. 我知道 fopen 和 fread 的 b 标志在所有 POSIX 兼容系统(包括 Linux)上都会被忽略,我把它放在那里以防代码在非 POSIX 系统上运行,并且还要明确我在做二进制 I/O
  3. 将错误检查和处理保持在最低限度,以防止此帖子成为文字墙(确实如此)。

希望对您有所帮助,

关于c++ - 我如何从 DICOM 文件中提取信息?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/29173386/

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