c - csc 中 spmv 的 openmp 并行化

Question

当矩阵采用压缩稀疏列格式时，OpenMP 如何并行执行稀疏矩阵 vector 乘法？

do i=1,lastcol
   do k=ia(i),ia(i+1)-1
      ind=ja(k)
      y(ind)=y(ind)+x(i)*a(k)
   end do
end do

这里，ia、ja和a分别是矩阵的列指针、行索引和非零值。谢谢。

Answer 1

以下内容对您有用吗(使用 ATOMIC 子句进行更新，以防止 Massimiliano 发现问题)

!$ OMP PARALLEL DO PRIVATE(k, ind, temp)
do i=1,lastcol
   do k=ia(i),ia(i+1)-1
      ind=ja(k)
      temp = x(i)*a(k)
      !$ OMP ATOMIC
      y(ind)=y(ind)+temp
      !$ OMP END ATOMIC
   end do
end do
!$ OMP END PARALLEL DO

这应该将外部循环的“工作”分配给多个不同的处理器，同时确保内部循环变量k和ind有单独的副本>

我已经有一段时间没有使用 OMP 了 - 如果这对您不起作用，请使用评论告诉我。同时有一个非常好的引用/教程here

此外 - 您会发现 similar question was asked earlier - 虽然语言是C，但基本循环结构非常相似。那里的对话表明，当矩阵变得相当大(超过缓存的大小)时，并行化的加速是最小的。