我想使用 pythonic 方法替换字符串中的一些字符。
A -> T
C -> G
G -> C
T -> A
例子:
AAATCGATTGAT
会变成
TTTAGCTAACTA
我做了什么:
def swap(string):
string = re.sub('A', 'aux', string)
string = re.sub('T', 'A', string)
string = re.sub('aux', 'T', string)
string = re.sub('C', 'aux', string)
string = re.sub('G', 'C', string)
string = re.sub('aux', 'G', string)
return string
效果很好,但我正在寻找一种更 pythonic 的方式来实现它。
最佳答案
使用带有理解和str.join
的字典:
translateDict = {
"A" : "T",
"C" : "G",
"G" : "C",
"T" : "A"
}
s1 = "AAATCGATTGAT"
reconstructed = "".join(translateDict.get(s, s) for s in s1)
这里有 live example
注意 dict.get
的使用;如果该字母不在字典中,我们就让它保持原样。
正如@bravosierra99 所建议的,您也可以简单地使用 str.translate
:
reconstructed = s1.translate(string.maketrans(translateDict))
关于替换字符的 Pythonic 方式,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/54918034/