我有两个文件;文件 1:
ARS-BFGL-BAC-10975 0.9303 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305
ARS-BFGL-BAC-11025 0.9092 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305
ARS-BFGL-BAC-11044 0.9626 688423261 2 01/04/2015 0.9983763305
ARS-BFGL-BAC-11193 0.9544 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305
ARS-BFGL-BAC-10975 0.9303 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000
ARS-BFGL-BAC-11025 0.9082 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000
ARS-BFGL-BAC-11044 0.9926 688423263 2 01/04/2015 0.9983763000
ARS-BFGL-BAC-11193 0.9144 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000
第二个文件,文件2:
ARS-BFGL-BAC-10975 10 21225382
ARS-BFGL-BAC-11025 10 84516867
ARS-BFGL-BAC-11193 1 29303546
期望的输出:
ARS-BFGL-BAC-10975 0.9303 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305 10 21225382
ARS-BFGL-BAC-11025 0.9092 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305 10 84516867
ARS-BFGL-BAC-11193 0.9544 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305 1 29303546
ARS-BFGL-BAC-10975 0.9303 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000 10 21225382
ARS-BFGL-BAC-11025 0.9992 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000 10 84516867
ARS-BFGL-BAC-11193 0.9144 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000 1 29303546
所以文件 1 的行数比文件 2 多。我只想保留文件 2 中基于第一列的输出行,所以我想要 ARS-BFGL-BAC-10975
重复出现在文件 2 中的第 1 列中的次数,但我不希望 ARS-BFGL-BAC-11044
出现在输出中,因为它从未出现在文件 2 中.
我最接近的是以下 awk 命令,但它不允许 ARS-BFGL-BAC-10975
被复制,即我只在输出时合并到文件 2 的长度应该更长。
awk 'FNR==NR{a[$1]=$2 FS $3;next} $1 in a {print $0, a[$1]}' file2 file1 > output
最佳答案
这按预期工作
$ awk 'NR==FNR{a[$1]=$2 FS $3; next} $1 in a{print $0, a[$1]}' file2 file1
ARS-BFGL-BAC-10975 0.9303 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305 10 21225382
ARS-BFGL-BAC-11025 0.9092 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305 10 84516867
ARS-BFGL-BAC-11193 0.9544 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305 1 29303546
ARS-BFGL-BAC-10975 0.9303 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000 10 21225382
ARS-BFGL-BAC-11025 0.9082 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000 10 84516867
ARS-BFGL-BAC-11193 0.9144 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000 1 29303546
没有限制有多少 file1 记录将匹配到 file2,但显然 file2 键应该是唯一的。当您运行相同的脚本时,我不确定您得到了什么。
如果您不介意丢失顺序,您可以使用join
和sort
ed 文件
$ join <(sort file1) <(sort file2)
ARS-BFGL-BAC-10975 0.9303 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305 10 21225382
ARS-BFGL-BAC-10975 0.9303 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000 10 21225382
ARS-BFGL-BAC-11025 0.9082 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000 10 84516867
ARS-BFGL-BAC-11025 0.9092 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305 10 84516867
ARS-BFGL-BAC-11193 0.9144 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000 1 29303546
ARS-BFGL-BAC-11193 0.9544 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305 1 29303546
只需一点点额外的杂耍,您就可以恢复秩序(装饰/取消装饰)
$ join -12 <(cat -n file1 | sort -k2) <(sort file2) |
sort -k2,2 | cut -d' ' -f2 --complement
ARS-BFGL-BAC-10975 0.9303 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305 10 21225382
ARS-BFGL-BAC-11025 0.9092 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305 10 84516867
ARS-BFGL-BAC-11193 0.9544 688423261 1 01/04/2015 0.9983763305 1 29303546
ARS-BFGL-BAC-10975 0.9303 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000 10 21225382
ARS-BFGL-BAC-11025 0.9082 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000 10 84516867
ARS-BFGL-BAC-11193 0.9144 688423263 1 01/04/2015 0.9983763000 1 29303546
关于Linux 合并文件 awk 命令,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/35977680/