我有一个非常大的文件，看起来像这样:
ENST00000629289"; transcript_version "2"; exon_number "22"; gene_name "CDK11B"; gene_source "ensembl_havana"; gene_biotype "protein_coding"; transcript_name "CDK11B-208"; transcript_source "ensembl"; transcript_biotype "protein_coding"; exon_id "ENSE00001594002"; exon_version "1"; tag "basic"; transcript_support_level "5";
ENST00000629289"; transcript_version "2"; exon_number "22"; gene_name "CDK11B"; gene_source "ensembl_havana"; gene_biotype "protein_coding"; transcript_name "CDK11B-208"; transcript_source "ensembl"; transcript_biotype "protein_coding"; exon_id "ENSE00001594002"; exon_version "1"; tag "basic"; transcript_support_level "5";
ENST00000629289"; transcript_version "2"; exon_number "22"; gene_name "CDK11B"; gene_source "ensembl_havana"; gene_biotype "protein_coding"; transcript_name "CDK11B-208"; transcript_source "ensembl"; transcript_biotype "protein_coding"; protein_id "ENSP00000485937"; protein_version "1"; tag "basic"; transcript_support_level "5";
我想提取所有以特定字符“ENST”开头的单词 我尝试了以下命令:
sed 's/.*\(ENST.*transcript_version\)/\1/p'
但它会打印出所有行。 有人可以帮我解决这个问题吗？
最佳答案
使用grep 和-o 选项只打印匹配的部分:
grep -Po '^ENST.*transcript_version' file
关于linux - 如何使用 bash 从大文件中提取所有以特定字符开头的单词？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/44666619/