我想将 3 个文件放在一起进行比较，看看文件中有多少信息是相同的。文件格式是这样的:
Chr11 447 . A C 74 . DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,8;MQ=15;FQ=-78 GT:PL:GQ 1/1:107,51,0:99
Chr10 449 . G C 35 . DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,7,8;MQ=20;FQ=11.3;PV4=0.055,0.0083,0.028,1 GT:PL:GQ 0/1:65,0,38:41
Chr12 517 . G A 222 . DP=122;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,77,40;MQ=23;FQ=-282 GT:PL:GQ 1/1:255,255,0:99
Chr10 761 . G A 41 . DP=93;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,34,6,35;MQ=19;FQ=44;PV4=0.29,1.8e-35,1,1 GT:PL:GQ 0/1:71,0,116:74
我只对前两列感兴趣(如果前两列相同，那么我认为它们相等)。这是我用来比较两个文件的命令:
awk 'FILENAME==ARGV[1] {pair[$1 " " $2]; next} ($1 " " $2 in pair)' file1 file2 | wc -l
我想使用 awk 命令，因为我的文件非常大，awk 处理它们非常好!但我不知道如何将它用于 3 个文件!
最佳答案
无意挑起编辑器大战，但我熟悉VI，vimdiff及其变体以并行 View 显示多个文件之间的比较，我觉得非常好用。简单地你可以用
调用它$ vimdiff <filelist>
关于linux - 我如何比较 3 个文件(以查看它们之间的共同点)？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/7964807/