linux - 运行带有长参数的 linux 命令时出现文件名太长错误

Question

我正在尝试从 100 个文件中剪切单个列，并使用此 linux 命令将它们粘贴在一起:

paste <(cut -f 5 file_1.tsv) <(cut -f 5 file_2.tsv) <(cut -f 5 file_3.tsv) ... <(cut -f 5 file_100.tsv) > combined.tsv

我收到这个错误:

File name too long

有什么解决办法的建议吗？

Answer 1

您收到此消息的原因可能是命令行大小有限。我建议你尝试用循环来做。这是您可以执行的操作的示例 --- 请注意，因为顺序可能不是您想要的:

#!/bin/bash
echo "" >  combined.tsv

#build your file list
find . -name "file*tsv" |sort -k1 > list_files.lst

#the process the list
while read x ; do
  x=`basename ${x}`
  paste <(cat combined.tsv) <(cut -f 5 ${x} ) > combined${x}.tsv
  mv combined${x}.tsv combined.tsv
done< list_files.lst

#you do not need it anymore
rm list_files.lst

(这个要放到一个文件里，比如myscript.sh，然后chmod +x myscript.sh，然后像下面这样运行

./myscript.sh

)