我有两个 ID 列表,正在与 comm
命令进行比较。我的问题是输出如下所示:
YAL002W
YAL003W
YAL004W
YAL005C
YAL008W
YAL011W
我想做的就是尝试以某种方式通过管道传输它,以便在写入文件时不包含空空格,当我在 excel
中打开此文件时,这些空空格会转换为白色单元格。我已经尝试了所有可能的 grep、awk 和 sed 组合来删除空格,但没有运气...
所以我得出的结论是,列分别由一个或两个制表符分隔,因此我不能删除它们就像删除空格一样容易,而无需删除文件的格式。
欢迎任何帮助或建议。 谢谢
编辑:
我希望我的输出为三列,制表符分隔,没有空格
YAL002W YAL004W YAL008W
YAL003W YAL005C
YAL011W
编辑2以避免引用的 XY 问题:
原始问题(X):我必须列出并且我想在两个列表之间找到共同和独特的单词(以便稍后生成维恩图)。所以 comm
似乎是完美的解决方案,因为我同时获得了所有三个列表,稍后我可以轻松地将其导入到 Excel 中。
第二个问题(Y):生成的三列不是三列(或者我开始这么认为),因为我不能 cut -f
它们,也不能使用常用的 awk 'NF'
或 grep .
删除空格(例如)。
最佳答案
给定此输入和 comm
输出:
$ cat file1
YAL002W
YAL003W
YAL008W
$ cat file2
YAL004W
YAL005C
YAL008W
YAL011W
$ comm file1 file2
YAL002W
YAL003W
YAL004W
YAL005C
YAL008W
YAL011W
这将满足您的要求:
$ cat tst.awk
BEGIN { FS=OFS="\t" }
{
colNr = NF
rowNr = ++rowNrs[colNr]
val[rowNr,colNr] = $NF
numCols = (colNr > numCols ? colNr : numCols)
numRows = (rowNr > numRows ? rowNr : numRows)
}
END {
for (rowNr=1; rowNr<=numRows; rowNr++) {
for (colNr=1; colNr<=numCols; colNr++) {
printf "%s%s", val[rowNr,colNr], (colNr<numCols ? OFS : ORS)
}
}
}
.
$ comm file1 file2 | awk -f tst.awk
YAL002W YAL004W YAL008W
YAL003W YAL005C
YAL011W
但是当然您可以跳过对 comm
的调用并立即使用 awk:
$ cat tst.awk
BEGIN { FS=OFS="\t" }
NR==FNR {
file1[$0]
next
}
{
if ($0 in file1) {
colNr = 3
delete file1[$0]
}
else {
colNr = 2
}
rowNr = ++rowNrs[colNr]
val[rowNr,colNr] = $0
}
END {
for (v in file1) {
colNr = 1
rowNr = ++rowNrs[colNr]
val[rowNr,colNr] = v
}
numRows = (rowNrs[1] > rowNrs[2] ? rowNrs[1] : rowNrs[2])
numRows = (numRows > rowNrs[3] ? numRows : rowNrs[3])
numCols = 3
for (rowNr=1; rowNr<=numRows; rowNr++) {
for (colNr=1; colNr<=numCols; colNr++) {
printf "%s%s", val[rowNr,colNr], (colNr<numCols ? OFS : ORS)
}
}
}
.
$ awk -f tst.awk file1 file2
YAL002W YAL004W YAL008W
YAL003W YAL005C
YAL011W
关于linux - 删除通讯输出中的空格,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/49681893/