linux - Netlogo HPC CPU 使用百分比增加

Question

我通过以下代码使用headless NetLogo 将作业提交到HPC 服务器:

#!/bin/bash
#$ -N r20p
#$ -q all.q
#$ -pe mpi 24
/home/abhishekb/netlogo/netlogo-5.1.0/netlogo-headless.sh \
    --model /home/abhishekb/models/corrected-rk4-20presults.nlogo \
    --experiment test \
    --table /home/abhishekb/csvresults/corrected-rk4-20presults.csv

下面是使用集群队列的快照:

qstat -g c

我想知道我能否为我的模拟增加 CQLOAD，它也意味着什么。我在网上找不到明确的解释。

CPU 使用情况检查:

qhost -u abhishekb

当我通过 gui 在我的 PC 上运行行为空间时，为任务分配高优先级使其使用近 99% 的 CPU，从而使其运行速度更快。它使用更大百分比的 CPU 处理器。我希望在这里完成同样的事情。

编辑:

编辑 2；

Answer 1

典型的 HPC 环境设计为每个 CPU 内核仅运行一个 MPI 进程(或 OpenMP 线程)，因此可以访问 100% 的 CPU 时间，并且不能进一步增加。相比之下，在经典的桌面/服务器机器上，许多进程竞争 CPU 时间，确实可以通过使用 nice 设置适当的优先级来提高其中一个的性能。

CQLOAD 似乎是该计算队列的平均负载。如果您没有使用其中的所有 CPU 内核，则它不是一个有用的指标。此外，即使是您运行的每个内核的平均负载也只能转化为该 HPC 集群上代码的效率。例如，每个核心 0.7 的值意味着代码将 70% 的时间用于计算，而剩余的 30% 可能用于等待与其他计算节点通信(这也是必要的)。

归根结底，提高 HPC 集群上 CPU 使用百分比的唯一方法是优化代码。不过通常情况下，人们更关心并行扩展(即求解时间如何随 CPU 内核数量而减少)而不是 CPU 使用百分比。