linux - 如何计算空格分隔文件中行中数字的总和？

Question

我有这样的空格分隔文件:

probeset_id submitted_id chr snp_pos alleleA alleleB 562_201 562_202 562_203 562_204 562_205 562_206 562_207 562_208 562_209 562_210 562_211 562_212 562_213 562_214 562_215 562_216 562_217 562_218 562_219 562_220 562_221 562_222 562_223 562_224 562_225 562_226 562_227 562_228 562_229 562_230 562_231 562_232 562_233 562_234 562_235 562_236 562_237 562_238 562_239 562_240 562_241 562_242 562_243 562_244 562_245 562_246 562_247 562_248 562_249 562_250 562_251 562_252 562_253 562_254 562_255 562_256 562_257 562_258 562_259 562_260 562_261 562_262 562_263 562_264 562_265 562_266 562_267 562_268 562_269 562_270 562_271 562_272 562_273 562_274 562_275 562_276 562_277 562_278 562_279 562_280 562_281 562_283 562_284 562_285 562_289 562_291 562_292 562_294 562_295 562_296 562_400 562_401 562_402 562_403 562_404 562_405 
AX-75448119 Chr1_41908741 1 41908741 T C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 
AX-75448118 Chr1_41908545 1 41908545 T C 2 2 2 2 2 2 2 2 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 0 0 0 0 0 1 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 2 2 2 0 1 1 1 2 -1 1 2 0 0 2 1 1 0 1 0 1 2 1 0 0 1 2 2 1 2 2 0 1 2 2 2 2 2 2 0 1 0 0 0 1 2 2 2 2 0

我想做的是计算每一行中所有数字的总和，如果有一个负数(只存在 -1)就忽略它，所以我想得到这样的结果:

AX-75448119 Chr1_41908741 1 41908741 T C 13 

(即 1+1+1+1+1+1+1+1+2+2+1)

和

AX-75448118 Chr1_41908545 1 41908545 T C 98

在这种情况下 -1 被忽略了!

我正在考虑在 Linux 中使用 awk，我通常将它用于空格分隔的文件，但我只知道如何将它用于列而不是行

Answer 1

这可能是您使用纯 awk 寻找的东西。

awk 'NR >=2 {for (i=7;i<=NF;i++) if ($i !~ /^-/) sum += $i; print $1,$2,$3,$4,$5,$6,sum; sum = 0}' data.txt

输出:

AX-75448119 Chr1_41908741 1 41908741 T C 13
AX-75448118 Chr1_41908545 1 41908545 T C 98