sql - 实现关系数据模型: what are the constraints for this table?

Question

我正在尝试提出一个关系模型和数据库实现，但不断遇到这个问题。但我什至不知道该叫什么!改进标题的建议将不胜感激。

我试图将问题归结为基本问题。

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简化示例:

这是 MySQLWorkbench 图表:

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如您所见，问题全部出在 Atom 表上。

期望目标概述:

• 我需要存储特定蛋白质原子的数据
• 我可能有某些原子的数据，也可能没有任何原子的数据
• 我不希望能够插入垃圾数据 - 我希望数据库约束能够防止这种情况发生

我不确定的是:

• 是否应该有一个Atom表——Atom_ref和Residue之间的连接似乎会生成蛋白质的所有原子-- 但我还需要存储有关原子的数据

问题概要:

• 每个原子需要一个残基和一个atom_ref
• 但是由于残基与残基引用相关联，因此原子引用只能是关联的(与残基引用)原子引用之一
• 不知道如何将Residue的residue_ref与atom_ref的residual_ref匹配

到目前为止我已经尝试过:

• 将 Atom_ref 的 pk 添加到 Atom 的 pk 中 - 但随后残基引用可能与 Residue 的不匹配
• 将 Residue.rr_name 更改为 pk 的一部分 - 违反了域语义

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我知道这对问题的解释很糟糕，我正在尝试如何更清楚地解释它!非常欢迎提出改进建议!

Answer 1

如果我理解正确，那么您所追求的是 (a) Atom 和 Residue 的连接与 (b) Atom_ref 之间的包含依赖关系。 (即 Atom 中的所有原子名称，与残差中为其定义的 rr_name 相结合，必须声明为有效组合，即必须出现在 Atomref 中)。

仅使用 RI/FK 来实现此目的的方法是将 rr_name 冗余地包含在 Atom 中。将 FK 从 Atom 扩展到 Residue 到所有三列。这将保证Atom中记录的rr_names与Residue中的信息保持一致。但是由于您现在已经在 Atom 中引入了 rr_name，因此您现在可以确保(通过从 Atom 到 Atom_ref 的 FKatomname+rrname)Atom 中记录的任何内容也与已声明的原子名称一致(在 Atomref 中)存在于所涉及的残基引用中。

请注意，此“解决方案”使更新数据库变得更加困难(需要维护更多冗余，从而导致更多违规可能性)，因为您刚刚降低了设计的 NF 级别。

另一种方法是保持设计不变，并通过对每个涉及的表(其中更新可能会导致违反业务规则)的适当触发器强制执行约束。也就是说，对 Atom_ref 进行删除和更新(即，任何导致有效存在于某处的有效组合消失的任何事情)，对 Residue 进行(rr_name 的)更新，以及对 Atom 进行插入和更新(即，任何可能导致出现某些组合的事情)。组合可能无效)。