sql - 从 Postgresql 表中绘制表和关系

Question

是否可以使用 R 绘制 postgresql 数据库中的表及其关系，如下所示？

Answer 1

对的，这是可能的。

至于怎么可能，请看下面的步骤

步骤

连接 PostgreSQL 数据库

获取数据库的架构信息

在数据结构中存储模式信息/将数据帧中的数据重新排列为数据结构。

从数据结构生成图

步骤 1

对于从 R 连接到 PostgreSQL 数据库，有多种机制可以这样做，包括

RPostgreSQL (R 到 PostgreSQL，持久连接)

sqldf (R 到 PostgreSQL，临时连接会自动执行第 3 步的一部分)，它具有 RPostgreSQL 作为依赖项。

PL/R (PostgreSQL 到 R)

db.r (R 到 PostgreSQL，内置了基本的数据库可视化，例如部分步骤 2,3,4，)

RPostgreSQL 中第 1 步的示例如下:

library(RPostgreSQL)

## loads the PostgreSQL driver
drv <- dbDriver("PostgreSQL")

## Open a connection
con <- dbConnect(drv, dbname="databasename")

步骤 2

这可以通过多种方式完成。可以直接在SQL中完成，也可以使用

RPostgreSQL 的 dbListTables 和 dbListFields 或两者的组合。

例如 SQL 查询数据库中的所有表，或表中的所有字段/列或表中的所有约束，请参阅以下 StackOverflow 答案

PostgreSQL Describe Table

Show tables in PostgreSQL

List all tables in PostgreSQL information schema

How do I list all columns for specified table DBA StackExchange

PostgreSQL to list foreign keys (您只需从 where 子句中删除或修改约束类型即可获取外键和主键)

总之，您只需查询 information_schema.tables、information_schema.columns 和 information_schema.table_constraints 即可获得您需要的信息。如果速度是一个问题(它们在上面的链接答案中提到)，您可以使用 PostgreSQL 特定表而不是 ANSI SQL 标准表，但它们可能会随着时间的推移而改变。

这里的步骤是

获取表列表

遍历表列表并获取每个表的列(或者只使用在结果集中包含表名和列名的查询来查询所有列)

遍历表列表并获取每个表的约束，或者只是使用在结果集中包含表名和约束名的查询查询所有列)

RPostgreSQL 中第 2 步的示例如下:

调整您的 SQL 以适应。

第 1 部分

用于获取表列表

使用内置函数

tables1 <- dbListTables(con)

使用 SQL

tables2 <- dbGetQuery(con, "select table_name from information_schema.tables")

第 2 部分

使用内置函数

您将使用 dbListFields(con,"TableName")，并应用于表格的前一个数据框。见 how to apply a function to every row of a matrix (or a data frame) in R或 Apply a function to each row in a data frame in R并将结果保存到变量中。

使用 SQL

columns2 <- dbGetQuery(con, "select table_name,column_name from information_schema.columns")

第 3 部分

使用 SQL

constraints <- dbGetQuery(con, "select table_name,constraint_name, constraint_type from information_schema.table_constraints")

步骤 3

从第 2 步开始，您应该有表格列表、表格列表及其相关字段/列，以及表格列表及其相关约束。

您需要为 CityPlot 输出 csv 文件以供使用，或为 GraphViz 输出点文件，或 igraph 的图形格式或数据框或 hash为了使用绘制表格的函数进行处理，并使用网格或图表绘制它们之间的连接。

如果您将它们组合成单个数据帧，子集和合并将很有用。

第 4 步

这一步也可以通过许多不同的方式来完成。这些包括但不限于

grid-package (有关与您请求的用例匹配的示例文章，请参阅引用文献中的 pdf)，低级图形原语

diagram package和 shape package (有关用法示例，请参阅引用资料中的 pdf)略高级别的图形基元

Rgraphviz package (Graphviz，基本上要么生成点文件第 3 步，要么查看引用文献中的 pdf 以获取更多信息)

igraph package (只会为每个列和表组合生成扁平圆圈)

CityPlot package (生成实体关系图而不是数据库表图，但可能满足您的需求，需要第 3 步从数据框生成 csv 文件)

如果使用图表、形状或网格包，您将遍历表列表、哈希或其他数据结构，并对每个表应用绘制函数，然后为每个约束应用单独的函数进行绘制线条。

引用文献

R an PostgreSQL using RPostgreSQL and sqldf

Youtube video Example: PostgreSQL Connection to R

Drawing Diagrams with R

R Package diagram: visualising simple graphs,flowcharts, and webs

Example RPostgreSQL usage

Dot Guide For Graphviz

How To Plot A Graph Using Rgraphviz