我正在尝试使用 exec 从 PHP 运行 R 命令。我知道使用 RServer 或套接字连接更有意义，但这些选项目前对我不可用。
代码如下所示:
$cmd = '/var/www/r.sh';
exec($cmd, $out, $return_var);
r.sh 包含以下内容
#!/bin/bash
source /home/ubuntu/.bashrc
cd /home/ubuntu
R CMD BATCH RFile.R
当我从 shell 执行命令时，它工作得非常好。当我从 PHP 运行命令时，出现以下错误:
> test( read.csv("OutData.csv",header=T,stringsAsFactors=FALSE,encoding="UTF-8"))
Error in library(randomForest) :
there is no package called 'randomForest'
Calls: test -> library
Execution halted
我最初的想法是这可能与权限有关。我已授予 www-data 读取所有内容的执行权限，但无济于事。我还以 www-data 用户身份从 shell 运行了该命令，并且运行良好。仅当从 PHP 调用时才会失败。
所以，我现在认为这是一个路径问题。 randomForest 是一个 R 库，并且已正确安装在盒子上:
ubuntu@<removed>:/var/www$ sudo find / -name randomForest
/home/ubuntu/R/x86_64-unknown-linux-gnu-library/3.0/randomForest
/home/ubuntu/R/x86_64-unknown-linux-gnu-library/3.0/randomForest/R/randomForest
我找不到任何设置路径的 shell 环境变量，所以我不明白为什么该命令可以在 shell 中运行，但不能在 PHP 中运行。
有什么想法吗？
最佳答案
相关的环境变量是R_LIBS和R_LIBS_USER； R Installation and Administration Manual是相关引用。如果您想查看如何在 R session 中设置这些变量，请尝试
ss <- Sys.getenv()
ss[grep("^R_LIB",names(ss))]
关于php - 无法从 PHP 运行 R 命令。路径问题？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/19897652/