我需要使用 BiomaRt，最好是 3.1 版本中的版本。请参阅:http://www.ensembl.info/blog/2015/06/01/biomart-or-how-to-access-the-ensembl-data-from-r/
我尝试按照上述页面中的安装说明在基于 Linux 的服务器上运行该程序。另外，我试过这个:http://www.bioconductor.org/install/#install-R , 但是，除非给予 root 权限，否则它们将无法工作。我已经使用这种方法加载了其他包 https://linuxishbell.wordpress.com/2010/12/10/install-r-package-without-root-accesson-linux/ ，但它们似乎不适合我的情况。最值得推荐的事情是什么？我已经在互联网上搜索过，但在这种情况下，Bioconductor 团队和用户提供的建议很少。
最佳答案
您无需从头开始安装 R 即可在没有 root 权限的情况下安装包。试试这个方法:
module load R
(假设这是集群上的 R，所以现在它在您的路径上，您可以通过键入 R 来输入它)
export R_LIBS_USER=$HOME/apps/R:$R_LIBS_USER
(您仍在使用 Linux 命令行，还没有使用 R)
R
(现在你输入R)
install.packages("packagename")
干得好，它会把包安装到 HOME/apps/R
library(packagename)
(尝试一下，看看它是否有效)
关于linux - 如何在没有 root 权限的情况下安装 Bioconductor 软件包？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/30585221/