我是 python 和 Spyder 的新手。 我正在尝试使用 networkx 从具有格式的文本文件读取到图形中:
FromNodeId ToNodeId Weight
0 1 0.15
0 2 0.95
0 3 0.8
0 4 0.5
0 5 0.45
0 6 0.35
0 7 0.4
0 8 0.6
0 9 0.45
0 10 0.7
1 2 0.45
1 11 0.7
1 12 0.6
1 13 0.75
1 14 0.55
1 15 0.1
...
我想使用可以存储这么大的图(大约 10k 个节点,40k 个边)的 Networkx 图格式。
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
g = nx.read_edgelist('test.txt', nodetype=int, create_using= nx.DiGraph())
print(nx.info(g))
nx.draw(g)
plt.show()
当我运行这段代码时,没有任何反应。 我正在使用 Spyder 进行编辑。 你能帮忙吗?谢谢!
最佳答案
您的注释第一行带有符号 #
(read_edgelist
默认跳过以 #
开头的行):
#FromNodeId ToNodeId Weight
0 1 0.15
0 2 0.95
0 3 0.8
然后修改read_edgelist
的调用来定义权重列的类型:
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
g = nx.read_edgelist('./test.txt', nodetype=int,
data=(('weight',float),), create_using=nx.DiGraph())
print(g.edges(data=True))
nx.draw(g)
plt.show()
输出:
[(0, 1, {'weight': 0.15}), (0, 2, {'weight': 0.95}), (0, 3, {'weight':
0.8}), (0, 4, {'weight': 0.5}), (0, 5, {'weight': 0.45}), (0, 6, {'weight': 0.35}), (0, 7, {'weight': 0.4}), (0, 8, {'weight': 0.6}), (0, 9, {'weight': 0.45}), (0, 10, {'weight': 0.7}), (1, 2, {'weight':
0.45}), (1, 11, {'weight': 0.7}), (1, 12, {'weight': 0.6}), (1, 13, {'weight': 0.75}), (1, 14, {'weight': 0.55}), (1, 15, {'weight':
0.1})]
关于Python从文件中读取以使用networkx创建加权有向图,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/45292159/