python - 运行 Numpy Meshgrid 时出现 MemoryError

Question

我有 8823 个具有 x,y 坐标的数据点。我正在尝试按照 how to get a scatter dataset to be represented as a heatmap 上的答案进行操作但是当我通过

X, Y = np.meshgrid(x, y)

关于我的数据数组的指令，我得到了 MemoryError。我是 numpy 和 matplotlib 的新手，主要是尝试通过调整我能找到的示例来运行它。

以下是我如何从存储了它们的文件构建我的数组:

XY_File = open ('XY_Output.txt', 'r')
XY = XY_File.readlines()
XY_File.close()

Xf=[]
Yf=[]
for line in XY:
    Xf.append(float(line.split('\t')[0]))
    Yf.append(float(line.split('\t')[1]))
x=array(Xf)
y=array(Yf)

我的阵列有问题吗？当放入 this example 时，同样的代码起作用了但我不太确定。

为什么我会收到此 MemoryError，我该如何解决？

Answer 1

您对 meshgrid 的调用需要大量内存——它会产生两个 8823*8823 float 组。它们每个大约 0.6 GB。

但是无论如何，您的屏幕无法显示(您的眼睛也无法真正处理)那么多信息，因此在执行此步骤之前，您可能应该想办法将数据平滑到更合理的值，例如 1024*1024 .