python - 将 seaborn 热图导出为完整的 pgf

Question

我正在尝试使用 seaborn 绘制热图并将其导出到 pgf 以便在 Latex 中轻松导入。这或多或少有效，唯一困扰我的是颜色栏作为额外的 png 导出。

因此，如果我运行导出到 pgf，我会得到以下信息:

• 测试.pgf
• test-img0.png

这绝对是不受欢迎的，因为 png 不能很好地缩放。 一些 MWE:

import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
import seaborn as sns

df = pd.DataFrame.from_csv("test.csv", sep=',')

sns.set('paper', 'white', rc={'font.size': 10, 'axes.labelsize': 10, 'legend.fontsize': 8, 'axes.titlesize': 10,
                              'xtick.labelsize': 8,
                              'ytick.labelsize': 8, "pgf.rcfonts": False})
plt.rc('font', **{'family': 'serif', 'serif': ['Times']})
plt.rc('text', usetex=True)
fig = plt.figure()
ax = sns.heatmap(df, linewidths=.5)
fig.savefig('test.pdf')
fig.savefig('test.pgf')

以及test.csv的内容:

0,1,2,3,4
1,1,1,1,1
2,2,2,2,2
3,3,3,3,3

有没有人有将颜色条包含到 pgf 输出中的解决方案？

Answer 1

我在导出到 pgf/tikz 的库中发现了一些特殊之处。

首先，在 matplotlib 中，四边形网格(即热图)正确导出为 pgf，但颜色条导出为 png(op 遇到的情况)。

我用 matplotlib2tikz 库尝试了同样的事情。在这种情况下，四边形网格导出为 png，但可以正确导出颜色图。但是，如果您抑制热图，例如通过将颜色图绘制到单独的 Axes 并清除热图轴，颜色条将导出为 png。

因此，如果您合并两个导出的输出，则可以同时拥有它们。

热图:

import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
import seaborn as sns
df = pd.DataFrame.from_csv("test.csv", sep=',')

sns.set('paper', 'white',
        rc={'font.size': 10, 'axes.labelsize': 10,
            'legend.fontsize': 8, 'axes.titlesize': 10,
            'xtick.labelsize': 8,'ytick.labelsize': 8, 
            "pgf.rcfonts": False,
           })
plt.rc('font', **{'family': 'serif', 'serif': ['Times']})
plt.rc('text', usetex=True)
fig, ax = plt.subplots(figsize=(6,6))
ax = sns.heatmap(df, linewidths=.5, ax=ax, cbar=False)
fig.savefig('heatmap_nocbar.pgf')

请注意，我使用 cbar=False

抑制了颜色条的绘制

然后获取颜色条:

import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
import seaborn as sns
from matplotlib2tikz import save as tikz_save

df = pd.DataFrame.from_csv("test.csv", sep=',')

sns.set('paper', 'white',
        rc={'font.size': 10, 'axes.labelsize': 10,
            'legend.fontsize': 8, 'axes.titlesize': 10,
            'xtick.labelsize': 8,'ytick.labelsize': 8, 
            "pgf.rcfonts": False,
           })
plt.rc('font', **{'family': 'serif', 'serif': ['Times']})
plt.rc('text', usetex=True)
fig, ax = plt.subplots()
ax = sns.heatmap(df, linewidths=.5, ax=ax, )
tikz_save('colormap.tex', figure=fig, strict=True)

解决方案现在需要一些肮脏的工作。我知道这确实不是好的做法，但这是我能找到的唯一方法。

在 colormap.tex 文件中，您需要删除除颜色图所需行之外的所有行。

colormap.tex 的开头:

\begin{tikzpicture}

\begin{axis}[

... % definition of axis: delete these lines

colorbar,
colormap={mymap}{[1pt]
...

所以你得到这个:

\begin{tikzpicture}

\begin{axis}[
hide axis,
colorbar,
colormap={mymap}{[1pt]
...

在文件末尾，删除方括号结束和 \end{axis} 之间的所有内容:

]
... %delete these lines
\end{axis}

文件中的这种更改可以自动进行，我在 github 上的代码中包含了一个示例

在你的主tex文件中，你可以添加这两个数字

\input{heatmap_nocbar.pgf}
\input{colorbar.tex}

如果您想要一个完整的工作示例和完整的输出，我已将此答案中的所有内容放在 github 上.

这对您来说可能远非一个完美的答案，但我缺乏 python 技能来更深入地研究 matplotlib 和 matplotlib2tikz 的后端来举一个更好的例子。