python - 具有分水岭的连通对象的图像分割

Question

我正在尝试分离连接的对象。 Python 和分水岭算法(scipy 实现)似乎很适合处理这个问题。

这是我的图像和自动生成的分水岭种子点(阈值和距离变换图像的局部最大值):

seeds = myGenSeeds( image_grey )

到目前为止，还不错；每个对象都有一个种子。

不过，当我运行分水岭时，事情就崩溃了:

segmented = ndimage.measurements.watershed_ift( 255 - image_grey, seeds)`

中上集群和中心集群都分离得很差。在顶部的集群中，一个物体淹没在另外两个周围。在中心簇中，虽然它可能太小而无法在这里看到，但中心种子仅淹没了几个像素。

我有两个问题:

1. 分水岭算法是分离此类对象的好选择吗？
2. 如果是这样，我是否需要进行某种预处理以使图像更适合分水岭分割？

Answer 1

我找到这个帖子是因为我在使用 watershed_ift 时遇到了同样的问题。我建议只使用 skimage.morphology 中的 watershed 函数。它接受浮点输入，因此您不会丢失灰度图像的分辨率，它实际上淹没了整个盆地，而 ift 方法似乎只淹没了标记所在的等值。

编辑: 一定要将距离变换乘以 -1，这样峰就变成了谷，否则你不会得到任何分水岭!