我有 HDF5 文件,我想使用 Python 模块 h5py(在 Python 2.7 中)打开这些文件。
当我有一个包含组和数据集的文件时,这很容易:
import h5py as hdf
with hdf.File(relative_path_to_file, 'r') as f:
my_data = f['a_group']['a_dataset'].value
但是,在我目前的情况下,我没有组。只有数据集。不幸的是,无论我尝试什么,我都无法访问我的数据。以下均无效(均因 KeyErrors 或 ValueErrors 而中断):
my_data = f['a_dataset'].value #KeyError
my_data = f['/a_dataset'].value #KeyError
my_data = f['/']['a_dataset'].value #KeyError
my_data = f['']['a_dataset'].value #ValueError
my_data = f['.']['a_dataset'].value #KeyError
如果没有解决方案,我可以重新制作我的文件以获得一个组。看起来确实应该有一个解决方案,但是......
h5py 似乎没有看到任何键:
f.keys()
[]
最佳答案
我发现了这个问题,我认为这是 h5py 应该解决的问题。
问题(我最初忘记在问题中详细说明,现在已编辑)是我使用相对 文件路径打开 hdf5 文件。当我使用 absolute 文件路径时,一切正常。
可悲的是,这会给我带来问题,因为我的代码旨在在不同的机器上可移植地运行......
感谢 gspr 和 jimmyb 的帮助:-)
关于python - 如何使用 h5py 读取只有数据集(没有组)的 HDF5 文件?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/28547745/