c++ - 直接在 Rcpp 中使用 (c)igraph(即不通过 R)

Question

我在 R 中使用 igraph。现在我正尝试迁移到 Rcpp。 igraph 是用 C 编写的，但可以从 R 调用。现在我想从 C++ 直接调用它。

目前我的 Rcpp C++ 代码调用 R，后者再次调用 C。这看起来很愚蠢。相反，我不想直接从我的 Rcpp C++ 代码调用 C 库。一种方法似乎是简单地下载 igraph header 并将其添加到 Rcpp 中:

#include <igraph-0.7.1\include\igraph.h>

但随后编译器提示它无法找到实际代码(仅 header ):

...
functions.o:functions.cpp:(.text+0x2fd): undefined reference to `igraph_matrix_set'
...

将所有 ipgraph 编译为 Rcpp 依赖似乎是一个 difficult ，或者至少我找不到关于如何做到这一点的好文档。

鉴于 igraph 是从 R 调用的，即在我的系统上运行，我怀疑应该有一种方法可以从 C++ 调用它而无需绕过 R，有点像

// [[Rcpp::depends(igraph)]]

如有任何指点，我们将不胜感激。

Answer 1

虽然 R 包可以提供其他 R 包可以调用的 C 函数，但 igraph 包不会这样做。我看到以下可能性:

• 游说 igraph 包也在 C 级别提供其功能，最好是提供补丁。有关详细信息，请参阅 WRE。

• 与系统安装的 igraph C 库链接，即您现在正在做的事情。

• 在您的包中包含 igraph C 库。

• 编写一个附加包，仅包含 igraph 库以及 C/C++ API 的必要代码。这在使用 Rcpp 时应该相对简单。